甲减的治疗最常用的就是所谓的补充疗法，甲状腺激素少了，就补充甲状腺激素，以前都用甲状腺片，也就是羊的甲状腺制剂，现在都是用优甲乐，就是左甲状腺素钠。但是用优甲乐的同时，因为它有兴奋作用，病人就会出现心慌、心跳快或者影响睡眠等不良反应，所以要求从小剂量开始，逐渐加大剂量来适应药物，能起到治疗作用，又不至于出现副作用；
另外，中医药治疗甲状腺功能减退症也有一定的疗效。中医药治疗主要以补肾为主，尤其是补肾阳，中医说阴中求阳、阳中求阴，可以用左归丸、右归丸、左归饮、右归饮这些方子，疗效是非常好的。
特别是甲状腺功能减退合并心脏的情况、合并肢体浮肿、心包炎、胸水、腹水，这个时候仅仅补甲状腺素可能比较慢，配上中药益气、温阳、利水、活血化瘀效果就很快能够改善症状，能提高患者的生存质量，防止出现病情加重。
