女性更年期抑郁往往比较特殊，因为激素水平发生了变化，卵巢功能出现了衰退，此时服用抗抑郁药有一些注意事项，要服用副作用比较小的药物，如艾司西酞普兰、盐酸舍曲林片等。如果有睡眠障碍，可以选用有镇静作用的抗抑郁剂，如曲唑酮。因为更年期抑郁往往不是普通的抑郁症，它与激素水平有关，可以服用以上这些药。
另外，女性更年期的时候，往往伴随内分泌紊乱，可能会出现肥胖的问题，尽量不要服用米氮平这样的药物，因为米氮平会增进食欲，会增加体重。如果有其他的焦虑症状，也可以联合用丁螺环酮、坦度螺酮。如果睡眠有问题，可以短期用佐匹克隆、唑吡坦等等这样导眠的药物。如果睡眠延续时间比较短，可以用稍微长效一点的苯二氮䓬类的抗焦虑和镇静的药物，如劳拉西泮、奥沙西泮。
