如果扁桃体肥大经过药物治疗效果不佳时，医生会建议进行手术切除，手术属于较成熟的技术，儿童手术占比最高。目前均为经口微创手术，手术创伤较小，主要风险如下：

1、术后出血：约有2%-3%的几率出现术后出血现象，此类患者70%在术后2天内出血，通常扁桃体术后在医院观察1-2天，相对更安全；

2、术后瘢痕：此类情况发生的概率较小，但黏膜上会出现手术瘢痕，可能导致吞咽不适感或发音异常。

此外，目前已有大量研究证明，3周岁后儿童切除扁桃体，对免疫力没有明显影响。