对于肝炎的患者而言病因治疗是关键，清除病因后才能有效恢复肝脏功能，同时还要联合保肝、护肝、抗纤维化的对症治疗。对丙肝的对因治疗，常见的效果比较好的是DNA药物治疗。在应用DNA药物治疗前，患者需要查丙肝的核酸，如果是阳性结果便应启动DNA药物的治疗方案，对于具体DNA药物的选择，取决于患者丙肝的分型以及否存在严重的肝纤维化、肝硬化，或其它共存的疾病，共用其它药物。
目前的抗病毒药副作用都比较小，几乎患者都能耐受。在进行抗病毒治疗的同时要联合护肝、降酶、抗纤维化的药物，以取得更好的治疗效果。一般丙肝抗病毒治疗的疗程为3-6个月，有时需要联合利巴韦林缩短抗病毒治疗的疗程，但有时并不需要合并利巴韦林，也不需要应用干扰素，通过口服丙肝的抗病毒药，即可达到清除、根治丙肝病毒感染的效果。
