胃溃疡做病理检查，通常属于比较严重的情况，此时医生会考虑是否为良性溃疡或恶性溃疡，即考虑存在癌症的可能性。内镜医生通常会对异常部分进行常规的活体组织检查，以明确性质，比如在溃疡时，如果医生高度怀疑存在恶性溃疡，会通过病理检查确诊溃疡性质。病理活体组织检查是胃部疾病的诊断的金标准，较多病变单凭胃镜较难区分和确诊，需要借助病理学检查确诊。
通常情况下胃镜对于可疑有病变的地方，会取下一块组织，对其进行病理切片后，在显微镜下观察组织细胞的形态以及腺体改变等。必要时可能还需要进行特殊的染色和标记，才能最终确诊，因此对于胃溃疡进行病理组织学的检查，通常是医生考虑患者可能存在恶性溃疡，即癌症的可能性较大。
