发生幽门管溃疡以后，基础治疗与其它溃疡并无区别，主要注意饮食的控制，饮食一定要规律，定时、定点饮食，不要暴饮、暴食，要注意细软、有营养的饮食，不要吃刺激和特别油腻的饮食。不要熬夜，不要把工作日程排得很满，这样都不利于溃疡愈合。

幽门管溃疡的药物治疗也与其它溃疡一样，也是使用质子泵抑制剂，如雷贝拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑等，强抑酸药对溃疡的愈合非常有效。幽门管溃疡的重要病因是幽门螺杆菌感染，所以应检测和根除幽门螺杆菌。