一旦肛瘘形成几乎无自愈可能，需要手术治疗才能根治，可以进行肛瘘切开术或挂线术，肛瘘迁延不愈包括以下原因：

1、肛瘘瘘道在肛门括约肌之间通过，由于括约肌经常不断收缩和舒张压迫瘘道，影响瘘道内脓液排出，因此脓液形成感染导致肛瘘难以自行愈合；

2、直肠内本身存在一定压力，可以将直肠内感染物质，例如粪便和气体，经常不断从内口进入瘘道，刺激瘘道腔壁，从而继发感染后由外口排出。

但目前肛瘘根治方法只有手术，服用消炎药、坐浴等方法对肛瘘肿痛、流脓等症状，虽然有一定缓解作用，但无法达到根治效果。如果不及时治疗，单纯性肛瘘可能变成复杂性肛瘘，低位肛瘘也有可能因为感染炎症逐渐变成高位肛瘘，增大治疗难度，患者也会增加痛苦。如果超过10年以上肛瘘，因为慢性炎症反复刺激存在一定癌变几率。因此肛瘘治疗一定需要高度重视，做到早发现、早治疗，避免拖延，以免增加治疗难度。