先天性无肛门在医学上称为先天性肛门闭锁，治疗手段是在确诊以后进行立即手术治疗。低位肛门闭锁可以进行一期成形术，而中位、高位肛门闭锁可以先行肠造瘘术，解决患儿排便问题，三个月后等患儿成长能够耐受手术，然后再进行根治性手术，手术方式如下：
1、会阴肛门成形术，一般适合于低位肛门闭锁；
2、后矢状入路肛门直肠成形术，又称之为Pena手术；
3、腹腔镜辅助下骶会阴直肠肛门成形术。
后两种术式适合于中、高位肛门闭锁手术，先天性肛门闭锁手术时机一般选择在生后24-48小时，如果时间太长，孩子会因为无法排便，腹胀逐渐加重危及生命。因此先天性无肛，其实需要急诊手术治疗。
