肾囊肿一般不会引起蛋白尿，但当囊肿长到足够大，影响到肾脏正常形态时，有可能出现尿蛋白。肾囊肿是由膨大的肾小管憩室组成，膨大的肾小管憩室随着囊液的分泌会逐渐增大，最后发展到肾囊肿。
在肾囊肿比较小时，囊肿内部就是囊液，对肾脏的实质没有太大的压迫作用，也不会引起肾脏功能的改变，所以一般不会出现尿蛋白。而且肾囊肿相当于肾小管的畸形，对肾小球的滤过功能没有影响，也不会破坏肾小球的滤过膜，不会让中大分子进入到原尿中，也不会影响到肾小管的重吸收。从这个意义上，肾囊肿不会引起尿蛋白。
但如果囊肿长得足够大，压迫到整个肾脏的实质，导致肾脏的形态和功能发生改变，病人就有可能出现尿蛋白。
