由于幽门螺杆菌根除治疗会使用铋制剂。铋制剂是一种含重金属的药，在临床上会用到如枸橼酸铋钾或果胶铋。铋剂吃了以后100%的人大便都会发黑。如果仅仅是大便发黑，其实不会影响到什么，可以继续服用幽门螺杆菌的药物，按时完成整个疗程。有的病人看到大便发黑，非常紧张，特别是老病人，因为消化道出血时，典型的也是黑便或柏油样便，这时如果没有其他不适，应该继续服药。
如果既往出现出血或同时伴有腹痛或心慌等，一定要除外是不是因为消化道出血造成，所以这时应该及时到医院进行检查。到医院检查大便潜血，才可以确定大便里面是不是含有血红蛋白，即大便发黑是不是由于出血造成。多数情况下，应该没有必要进行特殊处理，只需要继续服药即可。
