3个月吃2次紧急避孕药，可能会导致体内激素水平紊乱，进而导致月经周期异常。所以偶尔服用一般不会对身体产生太大影响，但是若将紧急避孕药作为一种常规的避孕方式，则可能对身体的影响较大。而且紧急避孕药的避孕有效性较低，即避孕失败的概率较大，所以通常不建议频繁使用。
通常情况下，月经周期的调节依赖于下丘脑垂体和卵巢轴的条件，如果服用紧急避孕药后，导致体内的激素水平的改变，可能使内分泌轴受到影响，从而导致月经周期的规律改变。而若想将月经周期调节至正常状态，则需要花费较多的精力和时间。
所以，通常建议女性尽量采用口服短效避孕药、坚持使用避孕套、放置宫内节育器，以及皮下埋植长效避孕药等有效的、常规的避孕方法，而减少服用，或不服用紧急避孕药。
