小儿鼻窦炎不管成人或小孩，既然是鼻窦炎症，主要是抗炎消肿治疗，最常用的是鼻部局部应用糖皮质激素，包括鼻腔冲洗或者鼻腔喷生理盐水，这是局部用药。另外，若脓性分泌物很多，配合负压置换疗法，通过压力改变将脓性分泌物吸出。再应用抗菌药物进入鼻窦，采取局部处理的方法。
小儿鼻窦炎也可全身用药，全身口服药物要适合小儿特点，最好甜的，少用苦的药。再就是冲剂，冲剂有些抗菌药物也可用，但是不要超过2周。黏液促排剂，如欧龙马滴剂呈滴类、液体状或者冲剂类适合儿童应用。也可使用中成药，如鼻渊通窍颗粒、玉屏风颗粒，这些都是颗粒类适合小儿特点的药物。
