患者包括医生对于胃肠道间质瘤，以及其他所有疾病来讲，都关心药物的副作用。总的来讲，胃肠道间质瘤靶向药物治疗的副作用，相对来讲比化疗要轻一点，但是无论哪一种靶向药物，都有可能出现副作用，而且不同患者出现副作用的大小也不一致。副作用的大小和很多因素有关，耐受情况也是一样。

伊马替尼和瑞派替尼这两种药物的副作用，相比较常用的5种药物来讲，副作用会比较少，也比较轻。伊马替尼最常见的副作用包括恶心、呕吐、乏力、水肿，主要是眼睑部水肿。这些副作用相对来讲都比较轻微，绝大多数患者经过调整后可以不进行剂量中断或者调整，耐受性非常好。

舒尼替尼和瑞戈非尼，也就是对于常用的二线、三线药物治疗来讲，因为它俩是多靶点激酶抑制剂，所以不良反应相对比较严重，包括疲乏、口腔黏膜刺激或者手足综合征，甚至高血压、蛋白尿。手足综合征是比较常见的，主要是手掌和脚底发红疼痛，甚至出现水疱，对于患者生活质量的影响较大，可以用护肤霜或者润肤露，要穿棉质衣服、鞋袜来改善症状。正因为这些副作用的存在，这2个药物涉及到剂量调整或者剂量中断，相对就要比伊马替尼和瑞派替尼多。还有一个阿伐替尼，它的不良作用比较特殊，会出现脑血管、认知障碍的影响。

所以总的来讲，在所有靶向药物治疗期间，副作用都是或多或少存在的，需要患者和大夫进行详细的沟通，对不良反应做出相应的处理，让患者在药物治疗期间能够更加平稳地度过，尽量减少不必要的停药或者中断影响治疗的效果。