通常药物流产最终的成功率＞90%，有10%的人最终可能需要选择做手术清宫。部分患者第一次口服流产药物，即米索前列醇，当天不一定排出妊娠组织，通常会在第二天加用药物，可最终成功排出妊娠组织。
另外，药物流产的出血时间通常比人流手术更长，多数为1-2周，最终在2周内彻底干净，也认为是流产成功。由于药物流产出血的时间延长，可能继发感染、不孕等情况，并发症风险反而更高。目前建议大部分患者在正规的医院进行人工流产。随着麻醉技术的全面发展，人工流产的痛苦极大地减少，手术的并发症比药物流产更小，对后续的影响也更小。
