小儿亚急性骨髓炎的治疗主要是有效抗生素应用和必要时的手术治疗。抗生素治疗即所说的用消炎药，在没有明确致病细菌之前，一般会选择广谱抗生素联合进行应用，当明确致病菌以后，要尽快选用敏感杀菌而不是抑菌抗生素。用药时间至少要持续4-7周，一般情况下先进行静脉给药即输液，输液3周后可以改为口服抗生素，等到症状体征明显改善或者消失以后2周再停药。经过积极的抗生素治疗以后，会有四种转归，具体如下：

1、X线片上出现骨脓肿之前炎症就得到控制；

2、X线片出现骨脓肿表现，但是全身局部症状消失，这时说明骨脓肿被控制可以被吸收，以上两种情况均不需要手术；

3、骨硬化比较轻病灶比较小，特别是位于干骺端的病灶，即位于骨端的病灶，可以先行抗生素治疗，如果抗生素治疗无效可以考虑手术；

4、全身症状好转，但局部症状加剧，该情况要立即进行手术治疗。手术治疗主要是行病灶清除术，术中要注意充分把病灶显露清楚，开窗时要开的足够大，把病灶显露的特别充分，清创之后要进行充分引流。做完手术之后仍需要继续抗生素治疗，并且时间要足够长，一般情况下要用1-2个月。同时要注意补充热量多吃高蛋白、高维生素的饮食，要注意纠正贫血，可以吃清热解毒、扶正补气的中药。同时局部要加辅助治疗，如肢体可以做皮肤牵引或石膏托固定，主要目的是制动，制动可以起到止痛、防止关节挛缩畸形和病理骨折的作用。