肠镜检查所用时间与患者肠道清洁状态、肠道拐弯情况，以及检查医生熟练程度等有关。假如医生熟练的情况下，10分钟左右就能做完检查，若医生不熟练或者遇到肠道内大便太多、肠道清洁不佳，以及患者以前有手术史、肠粘连等情况，可能需1小时左右。
肠镜检查时间虽不长，但肠道提前准备时间较长，患者需提前几个小时服泻药，进行肠道清理，把肠道内大便排空。肠镜检查后，假如肠道内没有发现明显病变，比如炎症、溃疡、息肉或者肿瘤，可马上拿到报告。假如肠道内有息肉、炎症、溃疡或者肿瘤性病变，需根据病变部位取病理进一步明确病变性质，大概需3-5天拿到病理结果。
