怀孕有囊肿不会影响胎儿，怀孕以后、特别是早孕期，两侧卵巢可能会发生黄素囊肿，这种囊肿无害。如果是怀孕伴发附件或者卵巢的实质性肿瘤，要警惕恶性肿瘤的可能，应该做肿瘤标志物的检测来判断是否有恶性的表现。

如果肿瘤生长过快，应该及时在中孕期手术，了解包块的性质，以免延误治疗。如果晚孕期附件囊肿，同时有剖宫产的指征，可以在剖宫产的同时，把囊肿摘除或者剥离。如果是良性的囊肿，可以自然分娩以后，再进行腔镜的手术，也比较有益。