如果为慢性胃痛，且经过对症治疗不能缓解，或者通过其他检查方法无法明确原因时，需要进行胃镜检查。胃镜从口腔伸进入，经过咽喉部、食管到达胃进行检查。除胃部检查外，胃镜还可对病变部位进行活检。同样可对活检病理进行幽门螺杆菌检测，检查患者有无幽门螺杆菌感染。胃镜检查的适应症为上腹部不适，包括腹痛、恶心、呕吐、嗳气、消化道出血。其次不明原因，怀疑有胃部占位性病变时，患者可以做胃镜检查明确。
此外，其他少数方法可以进行胃部疾病检测，如服用造影剂以后进行胃部超声检查。其优点为无创，检查相对较方便。但缺点是不能完全明确胃黏膜病变，且不能做活组织检查来确定病变性质。胶囊内镜主要检查部位为小肠，少数磁控胶囊可以检查胃、食道病变，缺点为不能做活检，以及费用昂贵。总之，通常胃部疾病首选胃镜检查。
