正常人的粪便中含有大量的细菌，粪便标本的检验必须是在混有大量正常菌的菌群中选出病原菌。大便培养检查项目如下：
1、一般的细菌培养，大便培养及鉴定通常需要48小时，常规检测的病原菌，包括沙门菌、志贺菌、弯曲菌，滨海城市的实验室，还应该检查气单胞菌和弧菌，血性粪便注意分离O157。除以上细菌外，通过大便培养可以分离到的病原菌，还有小肠耶尔森氏菌、邻单胞菌、致病性大肠杆菌，迟缓爱德华菌、蜡样芽孢杆菌、艰难梭菌、葡萄球菌、产酸克雷伯菌等；
2、可以查到真菌的培养，少量的真菌孢子在大便内存在，但是真菌性的腹泻多继发于抗生素治疗以后的菌群失调，多为白色念珠菌；
3、药敏试验，如志贺菌属、沙门菌属、气单胞菌属、邻单胞菌属、弧菌属等，仅肠内感染时，报告氨苄西林、甲氧苄氨嘧啶、磺胺甲恶唑和喹诺酮类的药物药敏结果，有侵袭性感染的病人存在多重耐药菌株时，同时报告第三代头孢菌素的药敏结果，霍乱弧菌同时应报告多西环素或者四环素类。