上火、尿道疼对应的西医诊断是尿路感染，尤其可能是下尿路感染。对于下尿路感染，主要的治疗药物是抗菌素，同时可以根据尿培养，以及药敏试验的结果，选择合适的抗生素。目前临床上推荐应用的药物，包括磷霉素氨丁三醇、匹美西林、呋喃妥因、喹诺酮类，以及第二代和第三代的头孢菌素。
对于女性而言，治疗通常是单剂疗法或者三日短程疗法。如果是老年女性，考虑到尿路感染的发生与雌激素减退有关，如果反复发作，可以在专业医师的指导下应用少量雌激素。
同时可以应用一些对症处理的药物，如黄酮哌酯类的药物，以及M受体阻滞剂，减轻膀胱的刺激症状。还可以尝试碱化尿液，主要是通过口服碳酸氢钠片进行处理。在日常生活中要求患者多饮水，注意休息、避免劳累等。
对于男性而言，除会有下尿路感染的可能，还可能会有男性生殖系统的问题。尤其是男性生殖系统的感染，也会出现上火、尿道疼的症状，最常见的原因是前列腺炎，需要按照前列腺炎的治疗方案进行处理。
