气管镜的检查具有很多的适应症，其目的性是检查气道是否通畅，可以发现气道内的异物，或者是气道内的病灶。同时可以通过气管镜的检查，留取病理的检查，比如确定病灶的性质，也可以通过气管镜的检查留取病原学检查，通过气管镜确定感染的致病菌。此外还可以通过气道的灌洗，确定部分气道炎症的性质，进而确定病因。此外气管镜还可以有一定的治疗作用，比如对于气道狭窄的患者，可以通过置放支架，进一步改善气道的狭窄。对于气道腔内的一些肿瘤，同样也可以具有治疗作用，比如气道内的治疗，对于某些哮喘的患者，也可以通过气管镜进行一定的治疗。
