莫西沙星不适合治疗尿路感染，因为莫西沙星虽然是喹诺酮类抗生素，且是四代喹诺酮类的抗生素，但代谢过程是双通道的代谢，更多的代谢是在肝脏中进行，所以导致在肾脏、尿液中的莫西沙星浓度相对较低。因此莫西沙星的说明书适应症中，也没有将泌尿系感染写入其中，更多的是治肺部感染、上呼吸道感染或用于抗结核的治疗等。
喹诺酮类抗生素在泌尿系感染中有非常重要的地位，最典型的是左氧氟沙星。左氧氟沙星不仅对泌尿系感染中常见的革兰氏阴性细菌，比如大肠埃希菌，具有很好的杀灭效果，且在尿液中具有很高的浓度。因为左氧氟沙星是经肾脏代谢，使其在尿液中的浓度10倍于血液中的浓度。因此在出现尿路感染后，首选左氧氟沙星。
