由于幽门梗阻主要是由胃十二指肠长期溃疡引起，因此控制患者的原发疾病，控制溃疡极为重要。临床中主要遵循早期和长期、积极而理性、综合治疗、治疗措施个体化等原则。对幽门梗阻患者进行疾病教育、医学营养治疗、手术治疗和药物治疗。
一、药物治疗
1、氯化钾：纠正失水与电解质紊乱是治疗幽门梗阻的首要问题，因为丢失胃酸多，存在不同程度的碱中毒。因此入院后可以先给生理盐水，待尿量增加，便需加入氯化钾溶液，低钾性碱中毒严重者甚至每天应补充氯化钾。
2、葡萄糖：水分的补充则用5%～10%葡萄糖溶液。按每天基础需要量2500mL计算，外加每天从胃管吸出的量和失水量的一部分。因此每天输入液体量，除按血生化测定结果输入适量的电解质溶液外，不足水分以葡萄糖液补充。
3、解痉药：胃肠痉挛原因是胆碱神经介质与受体的结合，引起胃肠平滑肌强直性收缩，引起患者疼痛。胃肠解痉药又称抑制胃肠动力药，主要为M受体拮抗药，包括颠茄生物碱类及衍生物和大量人工合成代用品。本类药物通过阻断胆碱神经介质与受体的结合，解除胃肠痉挛，松弛胃肠平滑肌，缓解疼痛，抑制多种腺体(如汗腺、唾液腺、胃液等)分泌，从而达到止痛的目的。此类药物可分为抗M胆碱受体药、季铵类抗胆碱能药、罂粟碱衍生物、胃肠道功能调节剂等。临床常用药物有：颠茄、山莨菪碱、阿托品等。
4、胃黏膜保护剂：患者由于长期胃病可导致胃组织破坏，因此可适量使用胃黏膜保护剂。
二、手术治疗
一般幽门梗阻的患者不宜施行紧急手术，如经过3～5天胃肠减压，患者能恢复饮食。病情逐渐好转，说明痉挛和水肿的因素得到消除，可继续观察。必要时重复钡餐检查。如减压无效则说明为瘢痕性狭窄，必须采取手术治疗。如有恶性肿瘤的证据，须积极手术。
1、溃疡前十二指肠残端缝合法：当溃疡近侧有足够十二指肠壁用于闭合残端，而其远端溃疡因瘢痕过多不易切除时，在无急性出血的情况下，可不必切除溃疡。先游离中、远端胃及近侧十二指肠，于近幽门处切断十二指肠，常规方法缝闭十二指肠残端。
2、幽门成形术：幽门成形术是一种胃排空性引流手术，一般不单独使用。常作为迷走神经干切断术和选择性迷走神经切断术、胃近端切除胃食管吻合术、贲门和食管癌切除胃食管吻合术的附加手术。
3、胃空肠吻合术：方法简单，近期效果好，死亡率低，但由于术后吻合溃疡发生率很高，故现在很少采用。对于老年体弱，低胃酸及全身情况极差的患者仍可考虑选用。
4、胃大部切除术：患者一般情况好，为最常用的术式。
5、迷走神经切断术：迷走神经切断加胃窦部切除术或迷走神经切断加胃引流术，对青年患者较适宜。
6、高选择性迷走神经切断术：高选择性迷走神经切除及幽门扩张术，取得满意效果。