小儿抽动秽语综合征治疗前需确定治疗的目标症状，即最大影响病人日常生活的症状，抽动多为目标症状，但有些病人的目标症状是伴随症状如强迫观念等，目前对于本病的治疗未见有突破性进展，治疗原则认为心理行为治疗和药物治疗，经积极治疗后可有效缓解症状，但易复发或加重，预后一般。
一、药物治疗
1、多巴胺受体阻滞药：是最有效的抑制抽动药物如氟哌啶醇，通常作为首选药物，治疗时可加用苯海索防止药源性椎体外系反应，另有匹莫齐特、硫必利、舒必利等。
2、选择性单胺能拮抗剂：可选用利培酮，但儿童需谨慎使用，另有奥氮平、舍吲哚等。
3、α受体激动剂：可选用可乐定，常将其作为治疗轻至中度多发性抽动症病人首选药物，尤其适用于多发性抽动症伴发注意缺陷多动障碍等相关行为问题患儿，另有胍法辛。
4、抗精神药物物：如阿立哌唑，属于第三代抗精神病药，用于治疗抽动障碍患者。不良反应轻微，可有恶心、呕吐、头痛、失眠、嗜睡、易激惹和焦虑等。
二、手术治疗
本病无手术治疗，以心理治疗和药物治疗为主。
三、心理治疗
轻重不同的多发性抽动症可对患儿自身及其家庭的日常生活和学习带来不同程度的干扰和影响。对多发性抽动症除药物治疗外，还应进行心理行为治疗，这对于任何一个多发性抽动症病人都是必不可少的，包括行为疗法、支持性心理咨询、家庭治疗等。对于本病的治疗在开始时主要是支持指导及对患儿家庭、学校等有关人员的教育，药物治疗不可代替这些工作。其中对于具有良好社会适应能力的轻症多发性抽动症患儿，只需要进行心理行为治疗即可，而不需要应用药物治疗，主要是予以心理调适，进行心理疏导。
四、其他治疗
伴发行为障碍治疗：1、伴发注意缺陷多动障碍的治疗：可选用可乐定，具有抗抽动和改善注意力作用，对于伴有注意缺陷多动障碍的多发性抽动症患儿可首选可乐定。另有地昔帕明、哌甲酯、舍曲林等。
2、伴发强迫障碍的治疗：可选用氟哌啶醇或泰必利合用氯丙咪嗪治疗。
3、伴发自伤行为治疗：可应用氟西汀。