上海市肺科医院结核科创建于1933年，是国内最早结核病预防、治疗和研究机构，拥有国内首个省部级结核病重点实验室。为中华医学会结核病学分会及中国医疗保健国际交流促进会结核病防治分会等国家级结核专业团体和上海市医学会结核学专科分会创建单位。
受卫生部委派，曾组织进行第一次全国结核病流行病学调查；并作为结核病控制分中心，分管南方16个省的结核病防治技术指导和培训工作；2017年入选上海市重中之重临床重点学科，2019年获上海市临床重点专科建设项目支持；并为全国耐药结核病防治示范基地、国家继续教育基地、上海市感染性疾病（结核病）临床医学研究中心、上海市耐多药结核病定点医院。
目前科室拥有5个病区、196张床位，每年收治住院患者18000余人次，诊治门诊患者约15万人次。在肺部疑难杂症鉴别诊治、支气管介入治疗、NTM与耐药肺结核、肺外结核等诊治、抗结核病新药临床研究及应用等结核病诊治方面均为国内领先水平。
在结核病快速诊断、治疗新方案研究、新开展电磁导航支气管镜和EBUS-GS联合分子生物学技术诊断结核病分子生物学方法快速诊断结核病对一线药物的耐药性等新技术应用及推广方面与国际同步。同时，作为上海市耐多药专家组组长单位，指导全市耐多药肺结核鉴别诊断及治疗工作。作为上海市结核病干保定点单位，承担全市干保结核诊治工作。
全科共有医师49人，专职科研人员5名，其中正高7人、副高16人，博导5名。拥有国务院政府特殊津贴专家、国家卫生部结核病专家咨询委员会委员、中华医学会结核病学分会名誉主任委员及常委、中华医学会结核病学分会非结核分枝杆菌专委会主任委员、中国医疗保健国际交流促进会结核病防治分会创建主任委员及常委、中国防痨协会常务理事、中国防痨协会第十一届结核病临床专业分会专家委员会主任委员及非结核分枝杆菌分会会主任委员、中华结核和呼吸杂志副主编、中国防痨杂志主编、副主编、上海市医学会结核病学分会主任委员、上海市防痨协会副理事长等国内知名专家和学科带头人，多人入选国家及省部级人才培养项目。
先后获得国家十一五、十二五、十三五科技重大专项课题、国家自然科学基金重点项目/面上项目、全球基金项目资助课题、上海市科委重点课题和上海市卫生局重点课题等国家及省部级课题20余项，涉及科研经费8000余万元。
参与抗结核新药全球多中心临床试验多项。拥有多项发明专利，近年分别获得中华医学科技奖、上海市医学科技奖和上海市技术发明奖等科技奖5项。近五年发表SCI论文113篇。受中国防痨协会和中华医学会结核病学分会的委托，科室先后负责起草《耐多药结核病化学治疗的意见（试行）》、《耐药结核病化学治疗指南》、《非结核分枝杆菌病诊断与处理指南》、《非结核分枝杆菌病诊断与治疗专家共识》、《抗结核药所致药物性肝损伤诊断与处理专家建议》等国家级技术规范与指南，并由中国防痨协会下发全国各结核专业防治机构。
主编《结核病专科医生培训教程》和《临床结核病营养学》、《结核病专业标准数据集》《结核病防治知识100问》等书籍。每年主办324结核病论坛，承担国家级结核病继续教育项目4项，线上学员可达20000余名。每年带教全国各地进修医师20余名，并协助国家CDC及全国所有省、自治区开展当地结核病专业人员的培训工作。
并获全国“最美防痨人”、“上海市十佳公共卫生工作者”、“中国防痨协会首届全国优秀科技工作者” 、“第七届“全国优秀科技工作者”、 中华医学会结核病学分会“结核病防治青年人才奖”、“上海市三八红旗手”、“上海市医学领军人才”、杨浦区第十批“拔尖人才”等称号。
