按照生物-心理-社会医学模式，心身疾病的诊断和防治都应该兼顾个体的心理、生理以及社会三个方面。心理诊断主要包括病史采集、体格检查、心理行为检查和综合分析。
1、病史采集：对疑有心身疾病的病例，在采集病史的同时，应特别留意收集个体心理社会方面的有关资料，包括个人发展史、个性或行为特质、个体的认知评价模式等，并分析这些心理社会因素与心身疾病发生发展的相互关系。
2、体格检查：与临床体格检查相同，但需要适当关注检查时病人的心理行为反应方式，有时可以观察病人对待体格检查和治疗的特殊反应方式恰当判断病人心理特质上的某些特点。
3、心理行为检查：对于初步疑为心身疾病者应结合病史资料，采用晤谈行为观察、心理测量或必要的心理生理学检查方法。所选的心理测验应着重测评病人的情绪障碍如焦虑、抑郁等。还可以采用适当方式评估其心理应激源、应对能力社会支持等。
4、综合分析：根据以上程序所收集的资料，结合心身疾病基本理论，对是否是心身疾病何种疾病、有哪些心理社会因素其主要作用以及可能的作用机制等问题做出恰当评估。
