性功能障碍是一组与心理社会因素密切相关的性活动过程中的某些阶段发生的生理功能障碍。性功能障碍的治疗有：
1、心理治疗：认知疗法、家庭治疗、婚姻治疗行为治疗、精神分析治疗等均可应用于性功能障碍的治疗。
认知疗法旨在改善患者从小建立起来的性是航脏的不道德的见不得人等错误认知。家庭治疗则着重调整家庭中各成员之间的人际关系。
婚姻治疗以夫妻关系为主线，调整夫妻二人的相互关系。而行为训练中的性感集中训练则较为知名，由夫妻双方共同参加治疗。
精神分析治疗则着力于处理患者的恋父或恋母情结。
2、药物治疗：西地那非，又称万艾可，治疗阳痿有效。它的作用是在有性欲及性刺激的情境下发挥的。万艾可不能增强性欲，也不能解决心理问题，所以它只能是心理治疗的辅助方法。
其他治疗激素替代疗法用于治疗内分泌异常。如果病因是源于正在服用的药物就要寻找既对原发病有效又对性功能没有影响的替代药物。对于某些因躯体疾病而出现性功能障碍的患者，原发病的治疗可直接使患者的性功能得到改善。
