右位心的并发症主要包括肺部感染、艾森曼格综合征，以及先天畸形。

一、肺部感染：

肺部感染是常见并发症，主要有两个要原因，由于胚胎左右不对称轴的建立，同样也影响到呼吸系统，气道纤毛的缺失、减少或功能下降，导致呼吸道防御功能下降而容易并发肺炎。

二、艾森曼格综合征：

艾森曼格综合征，右位心合并左向右分流型先天性心脏病，导致肺血增多。进行性的肺动脉高压发展至器质性肺动脉阻塞性病变，出现右向左分流，皮肤黏膜从无青紫发展至有青紫时，既称为艾森曼格综合征。

三、先天畸形：

1、镜像右位心常合并的先天性心脏病有IDD型矫正型大动脉转位、法洛四联症、室间隔缺损、心室双入口、三尖瓣闭锁、两腔心、二尖瓣闭锁、孤立性右心室流出道狭窄、完全性肺静脉异位引流、孤立性二尖瓣前叶裂隙等。在每一种复杂先天性心脏病中，还可合并房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭、肺动脉狭窄、二尖漏关闭不全、三尖瓣关闭不全、主动脉瓣关闭不全等多种先天性心脏病。

2、右旋心合并的先天性心脏病有矫正性大动脉转位、单心室(心室双入口)、右心室双出口、两腔心、三尖瓣闭锁、解剖二尖瓣功能三尖瓣、法洛四联症和室间隔缺损等。在每一种先天性心脏病中还可合并大动脉转位、肺动脉狭窄、室间隔缺损、房间隔缺损、房室瓣关闭不全、完全房室隔缺损、单心房、肺动脉高压、动脉导管未闭、主动脉瓣关闭不全和完全肺静脉异位引流等多种先天性心脏病。