小指根部疼痛可由多种原因导致：
1、外伤：外力作用可以导致骨、软组织损伤产生疼痛的情况，一般疼痛较剧烈，有明显的外伤史，可以协助诊断。患者需要行X线、CT和磁共振，判断骨与软组织损伤的严重程度，并采取保守或手术的方式进行治疗。
2、腱鞘炎：主要是屈肌腱周围的腱鞘组织发生了无菌性炎症，导致患者在掌指关节处触及肿大的隆起，压痛明显，关节活动受限。一般先采取保守方式进行治疗，保守治疗无效时可以采取手术的方式进行处理。
3、颈椎病：当颈椎间盘突出时，可以刺激一侧的神经根，导致神经支配区域出现疼痛、麻木的临床症状。需要进行颈椎CT、核磁共振、肌电图检查，明确诊断，进行指导治疗。
4、骨性关节炎：一般发生于关节部位，由于关节间隙变窄，可以出现小指根部疼痛，活动受限的临床症状，通常行实验室检查，影像学检查明确诊断。
