大三阳与小三阳的区别，唯一能够确定在化验单方面是乙肝五项，乙肝五项中有区别的仅仅是乙肝e抗原与e抗体这两项。大三阳的乙肝e抗原阳性，而小三阳的乙肝e抗原是阴性。大三阳的乙肝e抗体是阴性，而小三阳的e抗体是阳性。从相关的机制上来看，大三阳的e抗原阳性，说明体内的乙肝病毒复制比较活跃。
从临床的其他检查来印证，一般乙肝病毒的DNA定量就会稍微高一些，大多是高于10^4/L，但也有在10^4/L左右或者低于10^4/L。小三小的乙肝e抗原是阴性，乙肝病毒的复制就不那么活跃，这时所对应的乙肝病毒DNA定量就会稍微低一些，一般是低于10^4/L。
