乙肝大三阳可以口服恩替卡韦抗病毒治疗，恩替卡韦是目前首选乙肝抗病毒药物之一，治疗疗程至少四年。如果口服恩替卡韦治疗一年，出现了乙肝病毒DNA检测不到，转氨酶恢复正常，E抗原消失，并且产生了E抗体，再巩固治疗至少三年。在此期间，每隔六个月复查一次，一直保持不变的，可考虑停药观察，延长疗程可以减少复发。
在抗病毒治疗过程中应定期监测，每3-6个月做一次血常规、生化学、乙肝病毒DNA、肝脏弹性测定、彩超和甲胎蛋白等检查，以观察疗效和不良反应的发生。在停药后前三个月内，应每个月检测一次生化学指标、乙肝五项和乙肝病毒DNA，之后每三个月检测一次，每六个月做一次肝脏超声和甲胎蛋白的检测，一年后每六个月检测一次上述指标。
