1、中枢神经系统发育障碍及先天畸形脑发育不全常见于额叶、颞叶、脑室周围、胼胝体、脑白质等。先天畸形主要有神经管闭胼胝体发育落后，胼胝体发育不良.png合不全而形成无脑畸形、脑膜膨出和脑膜脑膨出、中脑水管畸形等；脑泡演化发育障碍导致全前脑畸形、小脑扁桃体下疝畸形等；神经元移行及脑回形成障碍导致神经元异常、平脑回或无脑回、巨脑回畸形、多小脑回畸形等；联合障碍或中线结构异常可有胼胝体缺如或发育不全、透明隔缺如或发育不全等。
　　2、脑室周围白质软化是脑损伤的主要神经病理改变，是存活患儿出现神经发育和行为障碍的主要原因。其发生机制为未成熟儿脑室旁白质供血动脉发育不完善，终动脉侧支循环尚未建立，由缺氧缺血所致。
　　3、产伤所致脑损伤产伤可为颅外产伤、颅骨产伤和颅内产伤。颅内产伤主要为硬脑膜撕裂、硬膜下血肿、脑缺血性梗死等。
　　4、胆红素脑病高胆红素血症时，胆红素通过血脑屏障，损害中枢神经系统的某些神经核，导致脑损伤。病变的特点是基底核、海马、下丘脑、齿状核等被染成亮黄色或深黄色。上述部位可有神经元变性、坏死，神经胶质细胞增生等变化。
　　5、缺氧缺血性脑病脑缺氧缺血是构成围生期胎儿或婴儿脑损伤的主要原因。基本病变主要有：脑水肿、脑组织坏死、缺氧性颅内出血等。近年来，缺氧或缺血所致细胞生化改变导致细胞受损或凋亡已被关注。
　　6、先天性感染先天性感染目前已被认为是主要致畸因素，不仅可以引起中枢神经系统畸形，病变本身也可造成小儿脑损伤。1987年，Nachmias首先把能导致先天性宫内感染引起畸形的病原体概括为TORCH，T为弓形虫(toxoplasmagondii)，R指风疹病毒(rubellavirus)，C指巨细胞病毒(cytomegalovirus)，H指单纯疱疹病毒(herpessimplexvirus)，O指其他(other)病原体。