治疗脑血管堵塞最好的药物，在急性期首先应该是静脉溶栓的药物，在发病3-4.5h之内，可以选择瑞替普酶来进行溶栓治疗。这样可以使血栓进一步遭到崩解，来减少对血管的堵塞。
除了静脉溶栓之外，还可以选择大血管的堵塞的情况下，可以选择血管内的拉栓，对于血管堵塞，在发病24h之内也是比较好的治疗。除此之外，对于血管堵塞，如果有动脉粥样硬化，在动脉粥样硬化的基础上出现动脉粥样硬化、斑块的破裂，有原位血栓形成的基础。
这种情况下治疗血管堵塞比较好的药物，是抗血小板聚集的药物，如阿司匹林和氯吡格雷，以及稳定斑块的药物，如他汀类的药物来防止不稳定斑块的破裂，治疗血管堵塞在不同的时期，治疗的药物和手段也不同。
