一般肾小囊肿不会造成严重影响，但随年龄增大，囊肿会逐渐增大，出现压迫、出血、感染等症状。根据引起囊肿的原因不同，最终结局也不同，根据病因不同可以将儿童肾囊肿分为以下几种：
1、与发育有关的肾脏囊性疾病；
2、获得性肾脏囊性疾病，该病在儿童较为罕见，预后大部分于原发病有关；
3、遗传性肾脏囊性疾病。
囊肿如果较小，一般不需要治疗，定期复查肾脏彩超即可。囊肿直径达到4cm以上时可能会压迫肾脏皮质，造成肾皮质变薄，影响肾脏功能，或囊肿压迫肾盂引起肾积水，需要微创手术治疗。囊性肾发育不良一般同侧肾脏无功能，髓质海绵肾一般预后较好。遗传性肾脏囊性疾病包括多囊肾、肾单位肾痨等。早期小囊肿暂时对人体无影响，但预后较差，最终会发展为尿毒症。因此儿童肾囊肿无论大小、多少，均应经过仔细检查予以鉴别。
