临床上进行幽门螺杆菌四联疗法的疗程是14天。很多患者在查体时都会发现幽门螺杆菌，进行治疗时目前通常采用四联疗法。
在疗程在指南中，幽门螺杆菌四联疗法的疗程是10-14天，如果有条件或患者的反应不是很大时，通常都把疗程放在14天，此时治疗效果会更好。
但部分患者服药后，可能副反应比较大，再就可能合并其他的基础疾病，服药后担心肝肾功能受损的可能性比较大，此时也可以将疗程放在10天。
幽门螺杆菌四联疗法的疗程固定在10-14天存在试验依据，在大样本的临床观察中发现，应用幽门螺杆菌四联疗法14天和使用比14天更长疗效，治疗效果基本相同，用药时间延长，也不会增加疗效。
如果治疗14天效果不好，表明细菌存在耐药的情况，并不是说药用的时间不够，此时需要更改治疗方案，而不是延长疗程。
