植物神经紊乱提示器质性疾病，造成的植物神经功能紊乱，主要是影响到植物神经的各种原因，包括药物中毒或者食物中毒，或者缺乏某些食物代谢性因素、自身免疫性因素、感染性因素等等，都会引起植物神经的功能紊乱。需要通过相关的检查，如血液血检查、血压监测和影像学检查腰椎脊髓，以及脑子的影像学检查，来排除器质性原因。
如果确定存在神经病变的植物神经，需要给予针对性治疗。如直立性的低血压，也可以通过排汗的反射来进行测定，有没有存在泌汗功能障碍，这些都是植物神经支配。一般如果是自身免疫性，需要给予免疫球蛋白治疗、血浆置换治疗改善症状。还有一部分患者，是功能性，通过这些检查以后，未见异常，但是存在植物神经功能平衡失调的症状，失眠、神经衰弱、躯体化障碍等，给予对应的功能治疗，来改善症状。
