若女性在怀孕时发现有囊肿需定期随诊、观察，但无需终止妊娠。女性妊娠期间常合并囊肿，囊肿通常不会对妊娠造成干预，但可能在妊娠期间发生破裂、扭转等并发症，甚至需要在妊娠期间进行手术治疗。但上述情况较为少见，并且孕期囊肿的手术治疗也不会导致流产等并发症的发生。
妊娠对囊肿存在一定影响，常导致囊肿增长但不至于导致囊肿恶变的出现。所以女性在孕期定期随诊观察即可，应定期通过B超检查囊肿情况。少数情况下，囊肿会表现为囊内出现乳头、囊壁不均质增厚，出现恶性病变的可能性，此时需及时地进行手术治疗。手术前后女性需要做好保胎处理，通常可以安稳度过围手术期。在孕晚期分娩时，若存在剖宫产的手术指征，则可在进行剖宫产的同时行囊肿剔除。
