早期肝癌一经确诊，首选的治疗方法是手术切除。肝癌细胞癌通过所在段叶门静脉播散，因此对肝癌相应段或叶解剖性切除是目前肝癌根治性切除的最好方法，术后根治率最高，复发率最低。另外也可以选择肝癌微波或射频消融等治疗手段。对于有些较小肝癌可以达到类似于肝癌手术的效果。肝癌局部消融治疗方法还包括冷冻氩氦刀，肝癌无水酒精注射等。目前最常用局部消融方法仍为射频或微波消融，它主要的优点是微创，对周围正常肝脏破坏较小，恢复快等。
随着外科技术不断发展，目前外科也逐渐开展腹腔镜下肝癌切除术，或腹腔镜下肝癌微波或射频消融术，可以达到与开腹手术相同的治疗效果。微创技术在临床上应用越来越广泛，治疗效果好，为外科医生所采纳，也受到了广大患者欢迎。对于肝功能衰竭等早期肝癌，也可以选择肝移植手术。但由于受到供肝来源，花费巨大等限制，无法广泛开展。
