肺癌的病理分型根据病理科接收到的活检标本、手术根治的标本而定。活检标本有两种类型，一种是通过纤支镜做内镜下活检，通常是周围型肺癌；另一种通过纤支镜没有办法取到组织，会进行影像学引导下穿刺，类似于活检标本。活检标本只能进行大概分型，比如小细胞癌，还是非小细胞癌。如果是非小细胞癌，可以通过免疫组化进行分型，确定是鳞癌还是腺癌。
手术根治后的标本可以根据肿瘤大小、浸润程度，判断是原位癌还是浸润癌。原位癌通常表现为贴壁生长，术前没有诊断，通常会做手术中快速诊断，明确是原位癌、微浸润性癌、浸润癌等。如果仅是原位癌，手术进行到此一步就可以结束。如果是明确的浸润癌，要进行相关区域的淋巴结清扫。手术后还要对标本进行整体评估，包括免疫组化状态、分子有没有特殊基因异常表达等，指导后续治疗。如果是小细胞癌，预后通常比较差，但对放疗、化疗比较敏感。
