腰部两侧隐隐作痛，最常见的原因一个是炎症，一个是先天性疾病，第三个是放射性疼痛。
1、炎症：炎症包括肾炎、肾盂肾炎、盆腔炎症、前列腺炎症等，这些炎症刺激到相应器官，就可以引起腰部的放射性的隐隐作痛或者是酸胀；
2、先天性疾病：先天性疾病包括肾囊肿、多囊肾等，都可以引起肾包膜受压，导致隐隐作痛；
3、放射性的疼痛：通常是腰椎间盘的问题，腰椎间盘问题可以压迫腰部的神经，引起腰部的隐隐作痛，慢性的腰肌劳损，也会引起腰部的隐隐作痛、腰部不适。
患者要做一些尿常规检查，了解尿液里边有没有异常表现，要做彩色多普勒超声检查，了解肾脏、输尿管、膀胱有没有其他病变，包括肾积水、肾结石、输尿管结石等，都能够发现。还要了解一下腰椎有没有问题，有没有腰椎间盘突出、神经根受压造成的隐隐作痛。所以出现两侧的腰部隐隐作痛后，要进一步检查，明确病因。
