鼻拭子和咽拭子最大的区别在于取材部位不同。咽拭子是在咽腔后壁摩擦取材，而鼻拭子要深入到鼻腔深部，在鼻道内进行取材。二者的目的都是通过摩擦取到脱落细胞，来检测脱落细胞内的DNA和RNA核酸，从而检测有没有要检测到的病毒。

鼻拭子和咽拭子在有些地方，用的拭子本身也不一样。咽拭子是一种扁平的、两面有些凸起的小颗粒，便于咽部摩擦。鼻拭子有时会有些小的毛刷，是圆的并不扁，便于深入到鼻腔，刷取鼻腔深处的脱落细胞。取材以后，都会同时被放到一个容器内，密封送到专门的检测机构进行检测。

在国内大多数地方进行全员核酸检测时，一般只做咽拭子。如果是密切接触者或者是次密切接触者，可能鼻拭子和咽拭子都要被测到。如果确定是密切接触者，和确诊的患者有过密切接触，鼻拭子、咽拭子，可能还加上肛拭子，即肛门拭子，3个地方都要检测，除此之外，还会被抽血。

如果是国外归来的人，鼻拭子、咽拭子、肛门拭子、抽血，都需要做。连续14天至少要测3次，全是阴性才能回到居住地进行居家隔离，再过7天没有问题再做一次，才能够完全解除隔离。

所以，鼻拭子和咽拭子，做全员核酸检测的时候用的都差不多，但是普通人都是做咽拭子，看不见鼻拭子的样子。