如果通过服用阿奇霉素治疗支原体肺炎，一般需要至少2-3个疗程，吃3天停4天或采用吃5天停2天的用法，需要根据病情的严重程度判断，如果是比较严重的支原体肺炎，甚至需要吃4个周期的阿奇霉素。同时针对支原体肺炎，除使用大环内酯类的药物进行抗支原体感染外，还需要进行对症处理，例如支原体肺炎如果出现发热，但只是低烧，可以先行物理降温，同时监测体温，如果出现高热的症状，可以酌情选用布洛芬或者是对乙酰氨基酚进行药物降温。在一次发热病程中尽量选用同一种退烧药，不到迫不得已，不要布洛芬和对乙酰氨基酚交叉使用，以免增加药物的副作用。
此外，支原体肺炎有时会出现咳嗽、喘息的症状，可以根据病情的严重程度，酌情口服化痰、平喘的药物，必要时还可以配合雾化吸入的药物，进行化痰、平喘治疗。如果使用雾化药物、口服药物不能缓解症状，必要时需要输液治疗，甚至是住院治疗。
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