尿液中的鳞状上皮细胞又叫复层扁平上皮细胞，主要来源于尿道的前段，女性有时尿液中混合有来自阴道的复层扁平上皮细胞。如果尿液中出现大量复层扁平上皮细胞，或者有片状的脱落复层扁平上皮细胞，同时伴有白细胞和脓细胞，最常见的疾病就是尿道炎。

尿液中的上皮细胞检查分为复层扁平上皮细胞，也就是鳞状上皮细胞，还有移行上皮细胞和肾小管上皮细胞，肾小管上皮细胞来源于远曲或者近曲肾小管，如果在尿液中出现肾小管上皮细胞提示有肾小管病变，通常在肾移植术后监测尿液中的肾小管上皮细胞，来观察是否存在有排斥反应。

尿液中的移行上皮细胞共分三大类型，其中表层移行上皮细胞来源于膀胱，中层移行上皮细胞来源于肾盂，底层移行上皮细胞来源于输尿管、膀胱和尿道，正常人尿液中没有或者偶尔有移行上皮细胞。在尿液中出现移行上皮细胞，通常见于泌尿系统的感染，如果大量出现，需要警惕移行上皮细胞癌的可能。