儿童打生长激素可能有副作用。任何药物都存在潜在副作用，副作用有暂时性和永久性。大部分药物说明书上标注药物副作用是暂时性，停药后机体自我循环代谢会把药物排除体外。这些药物在身体产生的副作用，随着药物代谢消失，如打生长激素后常见副作用是注射部位疼痛、红肿，打针后可能出现血糖偏高。
如果儿童有糖尿病家族史，或者有糖尿病，不主张应用生长激素。因为生长激素有升血糖的作用，打生长激素会使血糖升高。也要注意永久性副作用，尤其是儿童骨龄已经闭合打生长激素，可能造成肢端发育异常。副作用可能是永久性，即打生长激素前，医生要权衡利弊。
