甲状腺手术根据不同疾病，风险不一样，除了有麻醉风险、生命体征的影响等，还有独特的风险。最主要的风险是术中喉返神经、喉上神经以及甲状旁腺损伤，会造成严重后果。如果喉返神经损伤，会导致术后的声音嘶哑，如果双侧都损伤，会导致严重窒息。
喉上神经损伤会导致饮食时，尤其是喝水时呛咳或声调比较低，高音不上去。甲状旁腺如果损伤，有可能导致术后甲状旁腺素不足，引起低钙，导致手脚麻木，严重者甚至会导致四肢抽搐。术中大血管损伤会导致大出血，气管、食管损伤会造成相应症状。甲亢本身有甲亢危象，风险比较大，术后最主要的是出血风险，少量出血可能造成颈部血肿。
