单纯的肾脏结石和尿蛋白之间并没有直接关系，不会引起尿蛋白量增大，有些复杂的结石或者长时间的结石有可能会引起尿蛋白量增加。尿蛋白主要来源是因为肾脏功能受到损害，血里的蛋白成分从肾小球的滤过网里进行滤过，却没有被完全重吸收排到尿里面，主要和肾脏的功能损害有关。
肾结石的时候有两种情况，一种情况就是肾脏本身，有内科性的是肾小球肾炎或者肾病综合征。第二种情况就是肾脏结石引起的慢性肾盂肾炎，造成肾脏功能损害以后会出现蛋白尿。
如果这两种情况不存在，肾脏结石有的时候会在肾盂内形成炎症，会有红、白细胞在尿液里面，红、白细胞里面的蛋白成分可能会被认为是肾脏来源。因此要区分一下这些蛋白是炎症代谢引起的尿蛋白，还是肾脏本身的功能损害引起的尿蛋白。
而这两种情况，可以用同位素的分肾功能检查或分肾的肌酐清除率来检查，确诊到底是肾脏本身造成的尿蛋白，还是由于炎症代谢产物引起的尿蛋白量增加。
