儿童病毒性脑炎的主要治疗方法是对症支持治疗以及抗病毒治疗。对于病毒性脑炎的患儿，通常情况下表现症状较轻，仅出现发烧、头疼、精神状态较差、脑电图异常等，且治疗3-7天后症状明显缓解，无需通过较多的抗病毒药物或营养支持药物进行治疗。另外，儿童病毒性脑炎有自限性、自愈性，家长无需过度紧张，也无需进行过度治疗。
对于病情较危重的患者，会表现出严重的意识障碍或惊厥，此时需要积极诊治。建议患儿检查特殊的病毒，如单纯疱疹病毒、肠道病毒、流感病毒，若明确病毒类型，则可进行抗病毒治疗。对于流感患儿可采取相应的药物进行治疗，而对于存在单纯疱疹的患儿，可以用阿昔洛韦、更昔洛韦等药物进行治疗。患者在进行抗病毒治疗后，需配合对症支持治疗，属于预后的关键，比如止痉、降颅压等，并且可以进行调节免疫的治疗。因此，病毒性脑炎的预后与病因相关，患者应以对症支持治疗为主，而以抗病毒治疗为辅。
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