大多数病毒性肠炎可以通过对症治疗自行缓解，不同症状对应不同的药物治疗，具体如下：
1、腹泻：可以选择止泻的药物，如蒙脱石散等；
2、腹痛：可以选择调节肠道动力的药物缓解肠道痉挛，从而改善症状，如曲美布汀等；
3、菌群失调：可以补充益生菌调节肠道菌群，如双歧杆菌三联活菌、布拉氏酵母菌散、枯草杆菌二联活菌等；
4、脱水：少部分患者可能存在脱水的症状，需注意补充口服补液盐；
5、感染：合并细菌感染的患者，在进行对症治疗的同时，需进行抗细菌等抗感染的治疗；
6、肠道溃疡：部分病毒性肠炎，如巨细胞病毒性肠炎、EB病毒性肠炎可能会引起肠道的溃疡，从而引起症状持续。此时需要进行抗病毒治疗，使用更昔洛韦、膦甲酸钠类抗病毒药物。通常疗程需2周以上，才可得到明显改善，注意规律治疗后，需定期复查肠镜了解溃疡愈合情况。
