胎儿心脏病大部分能查出来，胎儿心脏出现问题，更多见于先天性心脏病。先天性心脏病分为很多类型，比如室间隔缺损、房间隔缺损、动脉导管未闭等，可以引起心内分流。而对于胎儿时期而言，部分结构例如动脉导管卵圆孔，在胎儿时期是胎儿存活必需结构，此结构在出生过后才能闭合，如果没有闭合称之为先天性心脏病。在胎儿时期，正常胎儿心脏超声检查，能够发现上述问题。
另外部分先天性心脏病，例如完全性肺静脉异位引流，此种疾病在胎儿时期不易发现，因为在胎儿时期，胎儿循环特点决定肺血流很少，所以肺静脉回到左心房的血很少。胎儿时期大多数先天性心脏畸形，可以通过胎儿心脏超声发现，但有较少的先天性心脏病可能不能够发现。此外需要强调胎儿心脏超声检查只是筛查手段，最终诊断需要根据出生过后超声，才能做明确诊断及病情轻重评估。
