长期服用雷贝拉唑，常见的副作用是影响钙的吸收，可能会导致患者骨质疏松。雷贝拉唑属于质子泵抑制剂，是经典的抑酸药物，较广泛用于治疗胃炎、胃溃疡、消化道出血、胰腺炎等消化疾病。部分患者将其作为较好的药物长期服用，部分患因病情需要而长期服用，但若是不需长期服用雷贝拉唑，建议缩短疗程或是间断服用来减少其副作用。
雷贝拉唑还有较多其他副作用，如胃肠道菌群失调、营养吸收障碍、胃黏膜改变等。如果患者有胃液反流、溃疡反复发作，并服用抗凝、抗血小板药物，此时出血风险较大，若需长期服用雷贝拉唑，应注意其副作用，应给患者及时补钙并多晒太阳，另外也可服用适当的益生菌来减少肠道菌群失调。
